Le Terme Euganee sono dotate di 110 hotel termali ognuno dei quali ha lo stabilimento termale interno. Il paziente pertanto non dovrà cambiare struttura per usufruire delle cure.

In ogni stabilimento termale opera una Direzione Sanitaria affidata ad un medico che provvede alla visita obbligatoria di idoneità e di ammissione alla cura termale, nonché ad una serie di altre mansioni che sono strettamente connesse alla erogazione di servizi ed assistenza di qualità, come sancito dall'art. 34 della Legge Regionale n.40.

L'applicazione del fango termale e l'erogazione del bagno termale avvengono, su indicazione del personale medico, da parte di personale paramedico in possesso di specifico diploma rilasciato dalla Regione Veneto dopo avere frequentato corsi di formazione professionale ed avere superato il relativo esame finale (fangoterapisti).

Anche la massoterapia, che completa la terapia termale standard (fango+bagno termali), viene praticata da personale qualificato (massoterapisti), di cui il Direttore Sanitario è direttamente responsabile .

Ogni reparto cure è dotato di un ambiente in cui vengono erogate le terapie inalatorie: inalazioni ed aerosol.

L'offerta terapeutica è, in genere, completata da prestazioni di fisiokinesiterapia (attiva e passiva), eseguibile in acqua termale o a secco e/o da altri tipi di massoterapia (linfodrenaggio, shiatzu, etc.).

Il reparto cure estetiche, in cui operano terapoestetiste termali diplomate, rappresenta frequentemente un complemento utile e qualificato per il trattamento, sempre tramite la risorsa termale, di quelle alterazioni estetiche (del viso, della pelle, delle mani, etc) che, pur non essendo malattie conclamate, turbano la percezione dell'immagine del proprio corpo e le relazioni con gli altri, tanto da potere precipitare notevoli componenti di disturbo psicologico e comportamentale.